設定が終了したら、(1)で停止させているサービスプログラムの設定を復帰し、Windowsを再起動します。
なお、Cygwinの詳しいライセンスにつきましてはこちらをご参照ください。 http://cygwin.com/licensing.html
(敬称は省略させていただきました)